Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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