Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt2Q3TTY5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms