Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Shcbp1lQ3TTP0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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