Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3TTL0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3TTL0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms