Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gdpd4Q3TT99 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdpd4Q3TT99 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms