Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calr4Q3TQS0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calr4Q3TQS0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms