Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc102aQ3TMW1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms