Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca4Q3TKT4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca4Q3TKT4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms