Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc13Q3TIR1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc13Q3TIR1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms