Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem248Q3TBN1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem248Q3TBN1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms