Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Jmjd8Q3TA59 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jmjd8Q3TA59 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms