Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-M3Q31093 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms