Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm1Q2TV84 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpm1Q2TV84 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms