Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLK6

B3gnt4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt4Q1RLK6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B3gnt4Q1RLK6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B3gnt4Q1RLK6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B3gnt4Q1RLK6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B3gnt4Q1RLK6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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B3gnt4Q1RLK6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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B3gnt4Q1RLK6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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B3gnt4Q1RLK6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B3gnt4Q1RLK6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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B3gnt4Q1RLK6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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B3gnt4Q1RLK6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms