Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Rpusd3Q14AI6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpusd3Q14AI6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpusd3Q14AI6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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