Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms