Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps8Q0P5W1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms