Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spata18Q0P557 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Spata18Q0P557 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms