Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Neurl1bQ0MW30 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms