Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cass4Q08EC4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms