Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Q08AU9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q08AU9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q08AU9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Q08AU9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Q08AU9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q08AU9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q08AU9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms