Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc4Q08624 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc4Q08624 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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