Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tgm3Q08189 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms