Protein–RNA interactions for Protein: Q08122

Tle3, Transducin-like enhancer protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle3Q08122 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tle3Q08122 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tle3Q08122 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms