Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cnn2Q08093 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnn2Q08093 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms