Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CbfbQ08024 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CbfbQ08024 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms