Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms