Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPINDOCQ05AH6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms