Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fmn1Q05860 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fmn1Q05860 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms