Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nf1Q04690 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms