Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tff2Q03404 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tff2Q03404 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms