Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddr1Q03146 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms