Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp11Q02853 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms