Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gjb5Q02739 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gjb5Q02739 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms