Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb4Q02738 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms