Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms