Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mc1rQ01727 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms