Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp1Q01514 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp1Q01514 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms