Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EgfrQ01279 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EgfrQ01279 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms