Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HmgcrQ01237 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms