Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2bQ01097 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Grin2bQ01097 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms