Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrcdQ00LT2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms