Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Serpina1cQ00896 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Serpina1cQ00896 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms