Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Itga4Q00651 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms