Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabpaQ00422 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms