Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb4P99026 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb4P99026 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms