Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cds1P98191 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cds1P98191 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms