Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca2P97929 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca2P97929 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brca2P97929 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brca2P97929 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms