Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx3-2P97503 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms