Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gata5P97489 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gata5P97489 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms